RM 8393人類DNA標準物質(zhì)(中國血統(tǒng))的操作注意
本標準物質(zhì)(RM)用于驗證、優(yōu)化和工藝評估。它由來自個人基因組計劃(ID hu91BD69)的東亞(中國)血統(tǒng)的男性基因組樣本組成,可用于評估基因組測序中變異調(diào)用的性能。RM 8393的單元由含有從來自Coriell醫(yī)學研究所(新澤西州卡姆登)的單個大生長的人類淋巴母細胞系GM24631(標記為HG-005)中提取的人類基因組DNA的小瓶組成。小瓶含有約10µg的基因組DNA,DNA在TE緩沖液中(10mM TRIS,1mM EDTA,pH 8.0)。
品牌:NIST標準品
RM Number(貨號):RM 8393
Description:Human DNA for Whole-Genome Variant Assessment (Son of Chinese Ancestry) (HG-005)
描述:人類DNA標準物質(zhì)(中國血統(tǒng))
Unit of Issue(產(chǎn)品規(guī)格):1 vial
NIST另有10支裝可選
RM 8393人類DNA標準物質(zhì)(中國血統(tǒng))的操作注意
儲存:RM 8393儲存在NIST的–20°C溫度下,但將與冷凍包一起裝運,可能不會冷凍到達。收到后,RM 8393應(yīng)在–20°C的黑暗中長期儲存,或在4°C的暗處短期儲存(如果即將使用)。
使用:建議將vcf與基準vcf進行比較后,只有基準區(qū)域內(nèi)的變體才會被視為真陽性、假陽性和假陰性。此外,為了了解假陽性和假陰性的原因,包括基準集中錯誤的可能性,強烈建議用戶使用基因組瀏覽器手動檢查假定假陽性和偽陰性子集周圍的對齊讀數(shù)。為了開發(fā)性能指標的標準化定義和工具,以比較具有不同表示的變體調(diào)用,全球基因組學和健康基準團隊聯(lián)盟發(fā)布了在人類基因組中基準種系小變體調(diào)用的實踐,我們強烈建議如下。隨著測序技術(shù)和分析方法的改進,這些基準調(diào)用和區(qū)域?qū)⒂貌煌夸浿形募木毎姹具M行更新,本調(diào)查報告將定期更新,以反映重要的新版本。當前版本包含來自基因組參考聯(lián)盟的GRCh37和GRCh38參考組件的小變體基準集。參考文獻4中描述了該基因組的各種技術(shù)的數(shù)據(jù)集。
部分NIST標準物質(zhì)產(chǎn)品目錄(僅列舉小部分):
RM 8376 | 用于檢測和鑒定的微生物病原體 DNA 標準品 | 20 tubes |
SRM 2383a | 嬰兒食品復合材料 | 4 x 70 g |
SRM 1958 | 強化人血清中的有機污染物 | 5 vials x 10.7 mL |
SRM 909c | 冷凍人血清 | 3 vials x 2 mL |
SRM 3186 | 磷酸根陰離子 (PO43-) 標準溶液 | 5 x 10 mL |
SRM 2775 | 鑄造用焦炭中的硫 | 50 g |
SRM 2385 | 菠菜泥 | 4 x 70 g |
SRM 1223 | 鉻鋼 | disk |
SRM 1082 | 香煙點火強度標準 | 1 carton (200 cigarettes) |
SRM 2556 | 用過的汽車催化劑(顆粒) | 70 g |
SRM 628 | 鋅基壓鑄合金 D(塊狀) | block |
SRM 125b | LA鋼,高硅 | 100 g |
SRM 762 | 磁矩標準 - 鎳盤 | 6 mm dia |